MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Anabaena variabilis ATCC 29413 plasmid A

Total Repeats: 7398

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007410	ATG	2	6	24	29	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007410	CATAA	2	10	103	112	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_007410	TAAT	2	8	120	127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007410	GTGTT	2	10	171	180	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007410	GA	3	6	204	209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007410	ATT	2	6	225	230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007410	ATA	2	6	269	274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812285
8	NC_007410	A	6	6	417	422	100 %	0 %	0 %	0 %	75812285
9	NC_007410	TC	3	6	478	483	0 %	50 %	0 %	50 %	75812285
10	NC_007410	TAAA	2	8	494	501	75 %	25 %	0 %	0 %	75812285
11	NC_007410	ACA	2	6	540	545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75812285
12	NC_007410	AT	3	6	609	614	50 %	50 %	0 %	0 %	75812285
13	NC_007410	A	6	6	630	635	100 %	0 %	0 %	0 %	75812285
14	NC_007410	TTCT	2	8	645	652	0 %	75 %	0 %	25 %	75812285
15	NC_007410	CAA	3	9	718	726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75812285
16	NC_007410	AAT	2	6	762	767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812285
17	NC_007410	TTC	2	6	814	819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812285
18	NC_007410	TCA	2	6	830	835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812285
19	NC_007410	TAT	2	6	876	881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812285
20	NC_007410	TGG	2	6	894	899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75812285
21	NC_007410	AATT	2	8	908	915	50 %	50 %	0 %	0 %	75812285
22	NC_007410	TG	3	6	984	989	0 %	50 %	50 %	0 %	75812285
23	NC_007410	T	6	6	1039	1044	0 %	100 %	0 %	0 %	75812285
24	NC_007410	AGTTA	2	10	1062	1071	40 %	40 %	20 %	0 %	75812285
25	NC_007410	ATG	2	6	1088	1093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812285
26	NC_007410	AGT	2	6	1120	1125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812285
27	NC_007410	ACT	2	6	1156	1161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812285
28	NC_007410	ATT	2	6	1210	1215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812285
29	NC_007410	TTA	2	6	1244	1249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812285
30	NC_007410	AAG	2	6	1260	1265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75812285
31	NC_007410	T	6	6	1277	1282	0 %	100 %	0 %	0 %	75812285
32	NC_007410	TTTA	2	8	1361	1368	25 %	75 %	0 %	0 %	75812285
33	NC_007410	TAA	2	6	1404	1409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007410	TC	3	6	1451	1456	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_007410	CTA	2	6	1475	1480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812286
36	NC_007410	T	6	6	1481	1486	0 %	100 %	0 %	0 %	75812286
37	NC_007410	GGA	2	6	1632	1637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	75812286
38	NC_007410	AAT	2	6	1708	1713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812286
39	NC_007410	ATTC	2	8	1723	1730	25 %	50 %	0 %	25 %	75812286
40	NC_007410	GCT	2	6	1739	1744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812286
41	NC_007410	GGC	2	6	1808	1813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75812286
42	NC_007410	CTA	2	6	1897	1902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812286
43	NC_007410	TGG	2	6	1942	1947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75812286
44	NC_007410	CGG	2	6	1989	1994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75812286
45	NC_007410	GCA	2	6	2007	2012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812286
46	NC_007410	CTG	2	6	2036	2041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812286
47	NC_007410	GTT	2	6	2044	2049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812286
48	NC_007410	TTA	2	6	2133	2138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812286
49	NC_007410	TCC	2	6	2247	2252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	75812286
50	NC_007410	TTC	2	6	2275	2280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812286
51	NC_007410	TGGAG	2	10	2445	2454	20 %	20 %	60 %	0 %	75812286
52	NC_007410	ATTAAC	2	12	2477	2488	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	75812286
53	NC_007410	CTG	2	6	2515	2520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812286
54	NC_007410	CTG	2	6	2529	2534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812286
55	NC_007410	T	6	6	2594	2599	0 %	100 %	0 %	0 %	75812286
56	NC_007410	TAGTG	2	10	2625	2634	20 %	40 %	40 %	0 %	75812286
57	NC_007410	CAC	2	6	2671	2676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75812286
58	NC_007410	TAAT	2	8	2680	2687	50 %	50 %	0 %	0 %	75812286
59	NC_007410	AGC	2	6	2717	2722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812286
60	NC_007410	CTC	2	6	2869	2874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	75812286
61	NC_007410	AAT	2	6	2914	2919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812286
62	NC_007410	CATTTA	2	12	2950	2961	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	75812286
63	NC_007410	TTC	2	6	2990	2995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812286
64	NC_007410	CCT	2	6	3066	3071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	75812286
65	NC_007410	AGC	2	6	3110	3115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812286
66	NC_007410	ATA	2	6	3139	3144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812286
67	NC_007410	GA	3	6	3157	3162	50 %	0 %	50 %	0 %	75812286
68	NC_007410	AGT	2	6	3230	3235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007410	GAT	2	6	3273	3278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007410	ATG	2	6	3300	3305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007410	TAAT	2	8	3339	3346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007410	GAA	2	6	3373	3378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007410	TTA	2	6	3401	3406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007410	TC	3	6	3432	3437	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_007410	ATA	2	6	3445	3450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007410	TAA	2	6	3555	3560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007410	GAT	2	6	3627	3632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007410	TTG	2	6	3672	3677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007410	T	6	6	3713	3718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007410	CTA	2	6	3757	3762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_007410	TGC	2	6	3780	3785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_007410	CCG	2	6	3828	3833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75812287
83	NC_007410	CCG	2	6	3937	3942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75812287
84	NC_007410	GCT	2	6	3957	3962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812287
85	NC_007410	ATC	2	6	3976	3981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812287
86	NC_007410	TAC	2	6	4075	4080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812287
87	NC_007410	CTT	2	6	4236	4241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812287
88	NC_007410	GCC	2	6	4251	4256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75812287
89	NC_007410	TCG	2	6	4383	4388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812287
90	NC_007410	GCA	2	6	4406	4411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812287
91	NC_007410	CT	4	8	4524	4531	0 %	50 %	0 %	50 %	75812287
92	NC_007410	TCC	2	6	4565	4570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	75812287
93	NC_007410	T	6	6	4685	4690	0 %	100 %	0 %	0 %	75812287
94	NC_007410	AGGT	2	8	4701	4708	25 %	25 %	50 %	0 %	75812287
95	NC_007410	GGT	2	6	4737	4742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007410	TCA	2	6	4763	4768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_007410	TA	3	6	4831	4836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007410	CAG	2	6	4854	4859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_007410	ACT	2	6	4892	4897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_007410	TTC	2	6	4972	4977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007410	A	6	6	5002	5007	100 %	0 %	0 %	0 %	75812288
102	NC_007410	A	6	6	5026	5031	100 %	0 %	0 %	0 %	75812288
103	NC_007410	TGC	2	6	5082	5087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812288
104	NC_007410	AC	3	6	5090	5095	50 %	0 %	0 %	50 %	75812288
105	NC_007410	AGC	2	6	5105	5110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812288
106	NC_007410	TCC	2	6	5157	5162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	75812288
107	NC_007410	TGAT	2	8	5262	5269	25 %	50 %	25 %	0 %	75812288
108	NC_007410	ATT	2	6	5379	5384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007410	CTT	2	6	5408	5413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_007410	CATA	2	8	5417	5424	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_007410	GAA	2	6	5438	5443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007410	TTTTCT	2	12	5457	5468	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_007410	AAC	2	6	5494	5499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_007410	GAT	2	6	5572	5577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007410	ATA	2	6	5599	5604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007410	TA	3	6	5603	5608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007410	TTA	2	6	5624	5629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007410	CTAT	2	8	5653	5660	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_007410	AGAT	2	8	5661	5668	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007410	TAAT	2	8	5689	5696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007410	TA	3	6	5698	5703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007410	TTGC	2	8	5754	5761	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_007410	ATA	2	6	5772	5777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007410	ATTTTT	2	12	5835	5846	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007410	ATC	2	6	5896	5901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812289
126	NC_007410	TGG	2	6	5993	5998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75812289
127	NC_007410	T	6	6	6006	6011	0 %	100 %	0 %	0 %	75812289
128	NC_007410	ATA	3	9	6025	6033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812289
129	NC_007410	T	8	8	6041	6048	0 %	100 %	0 %	0 %	75812289
130	NC_007410	T	6	6	6104	6109	0 %	100 %	0 %	0 %	75812289
131	NC_007410	AGA	2	6	6179	6184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75812289
132	NC_007410	ACAA	2	8	6215	6222	75 %	0 %	0 %	25 %	75812289
133	NC_007410	CAT	2	6	6234	6239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812289
134	NC_007410	TCT	2	6	6255	6260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812289
135	NC_007410	T	6	6	6267	6272	0 %	100 %	0 %	0 %	75812289
136	NC_007410	TAC	2	6	6286	6291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812289
137	NC_007410	GCA	2	6	6300	6305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812289
138	NC_007410	TC	3	6	6315	6320	0 %	50 %	0 %	50 %	75812289
139	NC_007410	CTG	2	6	6331	6336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812289
140	NC_007410	GAAA	2	8	6341	6348	75 %	0 %	25 %	0 %	75812289
141	NC_007410	TAG	2	6	6429	6434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007410	TTA	2	6	6436	6441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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278	NC_007410	GAT	2	6	11767	11772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812292
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282	NC_007410	CTC	2	6	11930	11935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	75812292
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295	NC_007410	T	6	6	12451	12456	0 %	100 %	0 %	0 %	75812293
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396	NC_007410	CAT	2	6	16781	16786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
397	NC_007410	AAGAA	2	10	16809	16818	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
398	NC_007410	ACA	2	6	16857	16862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
399	NC_007410	CTA	2	6	16989	16994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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401	NC_007410	T	7	7	17185	17191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
402	NC_007410	T	8	8	17216	17223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
403	NC_007410	AGC	2	6	17239	17244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
404	NC_007410	ATC	2	6	17245	17250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
405	NC_007410	GT	3	6	17310	17315	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
406	NC_007410	AGC	2	6	17366	17371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
407	NC_007410	CT	4	8	17385	17392	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
408	NC_007410	GGA	2	6	17415	17420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
409	NC_007410	AAT	2	6	17497	17502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812295
410	NC_007410	CCG	3	9	17507	17515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75812295
411	NC_007410	CATC	2	8	17548	17555	25 %	25 %	0 %	50 %	75812295
412	NC_007410	CGGGT	2	10	17642	17651	0 %	20 %	60 %	20 %	75812295
413	NC_007410	CTA	2	6	17683	17688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812295
414	NC_007410	GGA	2	6	17692	17697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	75812295
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416	NC_007410	ACTT	2	8	17839	17846	25 %	50 %	0 %	25 %	75812295
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419	NC_007410	ACGG	2	8	18071	18078	25 %	0 %	50 %	25 %	75812295
420	NC_007410	CGA	2	6	18096	18101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812295
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422	NC_007410	TG	4	8	18244	18251	0 %	50 %	50 %	0 %	75812295
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428	NC_007410	ATA	2	6	18527	18532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812295
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431	NC_007410	CCA	2	6	18577	18582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75812295
432	NC_007410	TGG	2	6	18742	18747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75812295
433	NC_007410	CCCA	2	8	18760	18767	25 %	0 %	0 %	75 %	75812295
434	NC_007410	CAA	2	6	18777	18782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75812295
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437	NC_007410	TAAG	2	8	18983	18990	50 %	25 %	25 %	0 %	75812295
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441	NC_007410	AAC	2	6	19127	19132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75812295
442	NC_007410	TGT	2	6	19137	19142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812295
443	NC_007410	TGG	2	6	19208	19213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75812295
444	NC_007410	GCG	2	6	19225	19230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75812295
445	NC_007410	TGA	2	6	19232	19237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812295
446	NC_007410	TGG	2	6	19253	19258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75812295
447	NC_007410	TTA	2	6	19277	19282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812295
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449	NC_007410	ATTC	2	8	19411	19418	25 %	50 %	0 %	25 %	75812295
450	NC_007410	TCA	2	6	19451	19456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812295
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491	NC_007410	CGG	2	6	21774	21779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75812296
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497	NC_007410	AAC	2	6	22165	22170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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499	NC_007410	A	7	7	22252	22258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
500	NC_007410	CAG	2	6	22269	22274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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